После долгих поисков нашел пару ответов что делать если при нажатии на кнопку удалить, или другую кнопку которая должна вывести диалоговое окно.
в файле /manager/assets/modext/util/datetime.js меняем строки:
,maxTimeValue: null
,minTimeValue: null 
на
,maxTimeValue: new Date('08/10/2014').clearTime().add('mi', (24 * 60) - 16)
,minTimeValue: new Date('08/10/2014').clearTime()
Переходим к редактированию файла /manager/templates/default/css/index.css строка 8032, класс .x-window свойство 
 opacity: 0; 
меняем на 
opacity: 1 !important;
Этот способ когда какие-то баги на серваке и криво отрабатывает js...
Также наблюдаются странные симптомы нет логов, нет ошибок. Страница перезагружается, и снова окно для входа в MODX. Решение нашлось, и был убит день:
Эти проблемы бывают редко и обычно после переноса сайта с хостинга на хостинг.